La floraison a lieu en été, l'hiver constituant une période d'inactivité pour la plante.
La plupart des espèces de lys perdent leurs feuilles pendant la saison froide, mais le lys rouge garde une rosette de petites feuilles à sa base pendant la plupart de l'année.
Les bulbes sont des organes de réserve, ils n'ont pas de couche protectrice. Les fleurs apparaissent à l'extrémité d'une unique tige verticale.